Yo no conozco la Alpha 900, pero en la 5D y 7D se tira un buen rato despues de las exposiciones largas haciendo el mismo "no se qué". Creo que lo hacen cuando tiene la "reducción de ruido activada". En mis cámaras lo puedes desactivar en el menú. Busca a ver si tu tambien lo tienes.

En la A300 es seleccionable. Es la reducción de Ruido por larga exposición (más de 1Seg). Se puede activar o desactivar. En realidad hace su trabajo de maravilla y está muy bién activado.

EDITO: Me he bajado el manual de la A900 y, en la tercera página del menú de grabación tienes la opción para activar/desactivar el "RR Exp. larga" (En la pág. 108 del manual está explicado)
Pero no creo que por software se puedan conseguir los resultados que consigue esta opción quitando el ruido que se genera en una exposición larga.

Efectivamente sólo hay que desactivar la reducción de ruido en las exposiciones largas, aunque por los resultados y tiempos de minutos es conveniente que esté activada.
Saludos