En realidad, no es un problema. Sucede cuando has modificado el contenido de la tarjeta desde fuera de la cámara.

El sistema de la cámara guarda una base de datos de las fotografías que se toman, para poder mostrarlas y manipularlas.

Si tú borras archivos desde el ordenador y vuelves a introducir la tarjeta en la cámara, se produce una incoherencia entre la base de datos de la cámara y el contenido de la tarjeta. No pasa nada; simplemente debe reconstruirse antes de realizar determinadas operaciones. Pero lo único que se modificará es el contenido de la base de datos, no se manipularán los archivos fotográficos.

Entonces tu dices que no se borran las fotos si le doy a "Intro"?

Ja jaaaaaa. No se borran. ¡¡Seguro!!.

De todas maneras, si quieres evitar que suceda, después de pasar las fotos al ordenador, formatea la tarjeta desde la cámara. O, lo que yo hao: provocar esa restauración de la base de datos con la tarjeta vacía, antes de que algún proceso de la cámara te la pida. Hay una opción en el menú para hacerlo.